保健食品由于各种功效成分或标志性成分在贮存过程中易受空气、温度、湿度、光线、微生物等因素的影响而发生各种复杂的物理、化学或生物化学方面的变化，进而影响保健食品的质量及使用安全，故选用适宜的保健品瓶及先进的包装技术与保健食品质量的优劣紧密相关，保健品瓶的主要作用首先是保护保健食品质量，防止保健食品功效成分或标志性成分失效变质——
缓冲作用
保健食品在运输、贮存过程中，要受到各种外力的振动、冲击和挤压，易造成破损。如玻瓶包装易碎裂；薄膜、纸袋之类包装又易压变形。为此，保健品瓶应具有缓冲作用，以防止震动、冲击和挤压。
(1)衬垫的作用:单个包装的内外都要使用衬垫，它是密封装置的重要组成部分，是防止震动的有利措施。丸、片等固体药物，常于保健品瓶内多余空间部位填装消毒的棉花、纸条或塑料盖上带的塑料弹簧圈，使瓶子寒满后药物无移动的空问。单个包装的外面(即保健品瓶之问)多使用瓦楞纸或硬质塑料作成瓦楞形槽板，将每个容器固定且分隔起来。目前还有用新材料：发泡聚乙烯、泡沫聚丙烯及聚乙烯和聚苯乙烯共聚树脂泡沫等缓冲材料作成缓冲包装的，效果良好。
(2)外包装又称分发包装:系以具一定机械强度的材料制成的大容器，具有防震、耐压和封闭的作用。
国际运输包装：除一般要求外，对完整、满装的运输包装，还要进行如下项目的检测：
①标示包装的部位及牢固性；②对温度、湿度的调节性能；③堆码实验；④通过跌落进行垂直碰撞实验；⑤水平碰撞实验、斜面试验、摆动试验等。
3、保护保健食品的功效成分或标志性成分
凡保健食品不管其剂型物态如何，一般均有遇空气易氧化、染菌，遇光易分解变色，遇湿易潮解变质，遇热易挥发、软化、熔解、崩裂，激烈的震动使变形、碎裂等等问题发生。保健食品物理性质或化性质的改变，均会使功效成分或标志性成分失效，不但不能起到保健作用病，有的反而会致病。况且多数保健食品有二年到三年左右的工厂保质期，在这么长的时间内，通过保健品瓶壁的微孔(如聚乙烯、聚丙烯等塑料)或保健品瓶与盖之间的间隙(密封不严实或变形)进入气体、水分都会导致保健食品的变质。在保质期内，保健食品保存中存在的问题由生产厂家承担责任。所以，保护功能对厂家、消费者来说皆至关重要。保健食品包装不论在造形、结构和装璜的设计上，还是保健品瓶材料的选择上，都应把保护功能作为首要因素来考虑，而保护功能的各个方面中(如防震、防寒、防热、防辐射、防虫蛀等等)，又以密封，即彻底与外界隔绝最为重要。